國立自然科學博物館所屬的車籠埔斷層保存園區，坐落於風景秀麗、交通便利的南投縣竹山鎮，緊鄰國道三號竹山交流道，是了解台灣地質演變與地震科學的重要場域。園區的核心使命，是展示921大地震後所發現的珍貴斷層剖面，並透過多元化的展示內容與互動設施，向大眾傳遞地質科學的知識與省思。

在售票口處的是車籠埔斷層保存園區的吉祥物，可愛的「穿山甲賴瑞」，牠以親切的姿態迎接每一位到訪者。

購票入館後，目光立刻被左側兩面牆上巨大的「車籠埔斷層槽溝剝片」吸引住了！這是921大地震後所發掘的「車籠埔斷層槽溝剝片」，這些剝片是保存槽溝地質構造的一項創新技術，透過膠體物質複製槽溝剖面原貌，並將泥砂「剝下」，進而得以展示槽溝的真實樣貌。剝片呈現的樣貌與實物左右相反，這些於2005年製作的軟質剝片，生動地記錄了斷層運動的證據。

車籠埔斷層保存園區建築分為兩層樓，一樓主要為「地質科學廳」，並設有一座劇場，定時播放與地質科學及地震相關的影片，內容會不定期更新，是深入了解科學知識的絕佳管道。而地質科學廳以豐富的主題設置，引導參觀者認識地質科學的奧秘。其中，對造成921大地震、長達92公里地表破裂的車籠埔斷層，進行了詳細的介紹。這裡展示了地質學家在探究斷層錯動紀錄時常用的三種研究方法：槽溝、鑽掘計畫與震測探勘。透過這些方法，科學家得以取得過往的錯動紀錄，並分析斷層的活動週期，進而推測未來潛在的錯動時間點。

除了嚴謹的科學展示，園區也巧妙地融入了趣味與體驗。精心打造的「台灣地形劇場」，利用3D地圖投影與熱氣球造景，讓觀眾彷彿乘坐熱氣球般，悠遊於台灣的山川大海之間，感受這片土地的地理多樣性。同時，園區也特別關注生態保育，將台灣特有的、已瀕臨絕種的中華穿山甲選為吉祥物，並設置了特展區，詳細介紹台灣穿山甲的習性、生活環境，以及保育牠們的重要性，期望藉此提升大眾對生物多樣性的重視。